Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
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