Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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