Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SNCBQ16143 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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SNCBQ16143 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNCBQ16143 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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