Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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ZIC1Q15915 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZIC1Q15915 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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ZIC1Q15915 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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ZIC1Q15915 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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ZIC1Q15915 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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ZIC1Q15915 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
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ZIC1Q15915 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ZIC1Q15915 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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