| ZIC1 | Q15915 | RNU6-928P-201 | ENST00000516876 | 104 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AP002748.2-201 | ENST00000528671 | 348 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AP000867.2-201 | ENST00000532468 | 320 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | OSBPL9P5-201 | ENST00000542581 | 171 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC093012.1-202 | ENST00000549403 | 582 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | TRAV28-201 | ENST00000557548 | 323 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AMZ2P1-203 | ENST00000565833 | 850 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC010547.2-201 | ENST00000568523 | 409 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | LINC01899-202 | ENST00000583756 | 575 nt | TSL 3 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC002545.1-201 | ENST00000592511 | 181 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | DUXAP4-201 | ENST00000603046 | 613 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | OR2AS2P-201 | ENST00000606902 | 342 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | ZRANB2-AS2-218 | ENST00000608360 | 722 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC131902.3-201 | ENST00000611767 | 581 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC091931.1-201 | ENST00000623488 | 728 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | C17orf112-201 | ENST00000623702 | 835 nt | TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC068057.2-201 | ENST00000624047 | 895 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC068544.1-201 | ENST00000635064 | 248 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC010149.2-201 | ENST00000637608 | 315 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | FAM35BP-202 | ENST00000497389 | 3337 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | FAM214A-201 | ENST00000261844 | 4217 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | ASNSP3-201 | ENST00000451989 | 1306 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AL049641.1-201 | ENST00000441055 | 1948 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | FAM184A-202 | ENST00000352896 | 3700 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | ANKRD18EP-201 | ENST00000405487 | 2632 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RAPGEF6-202 | ENST00000308008 | 4176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC108206.1-201 | ENST00000570186 | 4159 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | EIF2AK2-204 | ENST00000405334 | 1533 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | SPA17-201 | ENST00000227135 | 853 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | TEX43-201 | ENST00000357147 | 464 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AL512633.1-201 | ENST00000399931 | 655 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | SNORD88.1-201 | ENST00000408684 | 91 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RNA5SP184-201 | ENST00000411071 | 108 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | LINC00397-201 | ENST00000422074 | 344 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC093843.1-201 | ENST00000424395 | 512 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC063976.3-201 | ENST00000426849 | 329 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC007919.1-201 | ENST00000429380 | 217 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | PIGFP3-201 | ENST00000441918 | 722 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | UBE2D3P4-201 | ENST00000441973 | 436 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | KCNQ5-IT1-201 | ENST00000445310 | 563 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | COX6CP12-201 | ENST00000446748 | 202 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AP000936.2-201 | ENST00000447151 | 681 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC114485.1-201 | ENST00000447916 | 657 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC092264.1-201 | ENST00000456002 | 713 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AL031183.1-201 | ENST00000457667 | 207 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | UBE2DNL-203 | ENST00000474922 | 222 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | BET1P1-201 | ENST00000482276 | 359 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC114797.1-201 | ENST00000514003 | 728 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC107909.2-201 | ENST00000520844 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC107934.1-201 | ENST00000522215 | 217 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC136188.1-201 | ENST00000546770 | 342 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | HMGB1P14-201 | ENST00000557424 | 591 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC066612.2-201 | ENST00000559875 | 695 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AL157394.1-201 | ENST00000562983 | 1224 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | TTN-AS1-212 | ENST00000582847 | 1036 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | ABBA01006766.1-201 | ENST00000584728 | 294 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC099566.1-211 | ENST00000595188 | 737 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC012065.4-201 | ENST00000602445 | 679 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RPL12P50-201 | ENST00000603116 | 116 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC121334.2-201 | ENST00000605387 | 271 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC012360.2-201 | ENST00000609349 | 391 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | BX664608.1-201 | ENST00000610519 | 487 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | DLEU2_6.1-201 | ENST00000610536 | 112 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC138749.5-201 | ENST00000611461 | 208 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | UBE2Q2P6-201 | ENST00000612666 | 153 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC116165.2-201 | ENST00000616705 | 206 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | CR381653.2-201 | ENST00000624041 | 768 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| ZIC1 | Q15915 | MTND4P4-201 | ENST00000439033 | 1366 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | NOC3L-201 | ENST00000371361 | 3455 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | MIR133A1HG-202 | ENST00000581072 | 4226 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | OLFM3-206 | ENST00000536598 | 2801 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | ZNF680-202 | ENST00000447137 | 2159 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | THOC2-201 | ENST00000245838 | 5609 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | OR6C76-201 | ENST00000328314 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RNU4-21P-201 | ENST00000362802 | 126 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RNY4P16-201 | ENST00000364768 | 94 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RNY3P13-201 | ENST00000365542 | 102 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | C6orf62-201 | ENST00000378102 | 741 nt | TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | SNORD116-8-201 | ENST00000384365 | 95 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RNU6-1035P-201 | ENST00000384477 | 107 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | MIR34A-201 | ENST00000385130 | 110 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | MT-TH-201 | ENST00000387441 | 69 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | TRAV26-1-201 | ENST00000390455 | 537 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RNU2-33P-201 | ENST00000410344 | 192 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | LINC01412-201 | ENST00000413525 | 362 nt | TSL 2 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | ELOCP17-201 | ENST00000414751 | 326 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC009299.3-201 | ENST00000421122 | 1072 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AL136322.1-201 | ENST00000422250 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC019097.1-201 | ENST00000424783 | 735 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC092047.1-201 | ENST00000424997 | 240 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | LINC00407-201 | ENST00000426509 | 295 nt | TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AL356583.2-201 | ENST00000426536 | 280 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC244035.1-201 | ENST00000430042 | 390 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC236972.1-201 | ENST00000433225 | 199 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AL360169.1-201 | ENST00000435116 | 143 nt | TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC078845.1-202 | ENST00000435996 | 733 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | Z82210.1-201 | ENST00000440037 | 231 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | RPL21P2-201 | ENST00000440049 | 481 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | AC006458.1-201 | ENST00000445093 | 653 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| ZIC1 | Q15915 | USP9YP12-201 | ENST00000450481 | 570 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |