Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms