Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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SCN9AQ15858 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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SCN9AQ15858 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN9AQ15858 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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