Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms