Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms