Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDGFRLQ15198 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDGFRLQ15198 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms