Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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GPNMBQ14956 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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GPNMBQ14956 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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GPNMBQ14956 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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GPNMBQ14956 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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GPNMBQ14956 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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GPNMBQ14956 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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GPNMBQ14956 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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