Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms