Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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SHROOM2Q13796 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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SHROOM2Q13796 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
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SHROOM2Q13796 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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SHROOM2Q13796 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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SHROOM2Q13796 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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