Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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CACNA1SQ13698 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CACNA1SQ13698 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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