Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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