Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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