Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CLN3Q13286 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CLN3Q13286 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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CLN3Q13286 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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