Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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IFT88Q13099 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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IFT88Q13099 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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IFT88Q13099 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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IFT88Q13099 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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IFT88Q13099 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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IFT88Q13099 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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IFT88Q13099 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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