Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CSTF3Q12996 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CSTF3Q12996 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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