Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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