Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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NFIAQ12857 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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NFIAQ12857 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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NFIAQ12857 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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NFIAQ12857 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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NFIAQ12857 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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NFIAQ12857 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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NFIAQ12857 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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NFIAQ12857 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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