Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB40BQ12829 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms