Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
KCNMA1Q12791 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KCNMA1Q12791 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms