Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms