Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms