Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTPAP49638 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TTPAP49638 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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TTPAP49638 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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TTPAP49638 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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TTPAP49638 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TTPAP49638 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TTPAP49638 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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