Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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