Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms