Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms