Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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