Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms