Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms