Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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