Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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