Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SNAPC1Q16533 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SNAPC1Q16533 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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