Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms