Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SNCBQ16143 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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