Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SS18Q15532 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SS18Q15532 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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