Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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