Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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TTF1Q15361 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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TTF1Q15361 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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TTF1Q15361 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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TTF1Q15361 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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TTF1Q15361 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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TTF1Q15361 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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TTF1Q15361 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTF1Q15361 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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