Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms