Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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