Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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