Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms