Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SHROOM2Q13796 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SHROOM2Q13796 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHROOM2Q13796 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
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