Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CACNA1SQ13698 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CACNA1SQ13698 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CACNA1SQ13698 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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