Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms