Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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