Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRQ13535 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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