Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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