Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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SGCGQ13326 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCGQ13326 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCGQ13326 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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